In diesem Kurs werden Sie in die Fußstapfen der Bioinformatiker treten, die den COVID-19-Ausbruch untersuchten, indem Sie das SARS-CoV-2-Genom zusammensetzen. Egal, ob Sie neu in der Welt der computergestützten Biologie sind, oder ob Sie ein Bioinformatik-Experte sind, der mehr über die Anwendungen bei der COVID-19-Pandemie erfahren möchte, oder ob Sie irgendwo dazwischen liegen, dieser Kurs ist für Sie! Auf dieser Reise werden wir genomische Konzepte einführen und erklären und Ihnen viele Gelegenheiten geben, Ihre Fähigkeiten zu üben, und wir werden eine Reihe von Problemen mit allmählich steigender Komplexität bereitstellen. In diesem ersten Kurs geht es nur um die Assemblierung des SARS-CoV-2-Genoms. In zukünftigen Kursen dieser Reihe werden wir uns mit den bioinformatischen Folgeanalysen befassen, die bei der COVID-19-Pandemie eingesetzt wurden.
Hacking COVID-19 - Kurs 1: Identifizierung eines tödlichen Krankheitserregers
Dieser Kurs ist Teil von Spezialisierung Angewandte Bioinformatik
Dozenten: Mikhail Rayko
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Kompetenzen, die Sie erwerben
- Kategorie: Bioinformatik
- Kategorie: zusammenbau des viralen Genoms
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In diesem Kurs gibt es 2 Module
In Kapitel 1 reisen wir zunächst in die Vergangenheit, um etwas über die Geschichte des SARS-Ausbruchs von 2003 zu erfahren. Als nächstes reisen wir ins Jahr 2019, um mehr über die Ursprünge von SARS-CoV-2 zu erfahren, einem neuartigen Virus, das während der COVID-19-Pandemie weltweit Verwüstung anrichtete. Schließlich werden wir die Biologie hinter diesem mysteriösen Virus erforschen, während wir unsere ersten Schritte zum Hacking von COVID-19 unternehmen.
Das ist alles enthalten
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In Kapitel 2 erfahren wir, wie moderne Technologien die DNA in kleinen Stücken sequenzieren können. Als Nächstes werden wir lernen, wie wir SPAdes, ein beliebtes Tool zur Genomassemblierung, verwenden, um das SARS-CoV-2-Genom aus kleinen Fragmenten zu rekonstruieren. Schließlich werden wir lernen, wie wir mit QUAST die Qualität unseres zusammengesetzten SARS-CoV-2-Genoms bewerten können.
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Dozenten
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Geprüft am 5. Feb. 2021
Geprüft am 23. Dez. 2021
Geprüft am 30. Sep. 2021
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