Die letzten 15 Jahre waren aufregende Jahre in der Pflanzenbiologie. Hunderte von Pflanzengenomen wurden sequenziert, RNA-seq hat transkriptomweite Expressionsprofile ermöglicht, und eine Vielzahl von "-seq"-basierten Methoden hat es ermöglicht, Protein-Protein- und Protein-DNA-Interaktionen kostengünstig und im Hochdurchsatz zu bestimmen. Die Bioinformatik-Spezialisierung für Pflanzen auf Coursera führt in die Kernkompetenzen und Ressourcen der Bioinformatik ein, wie z.B. NCBI's Genbank, Blast, multiple Sequenzalignments, Phylogenetik in Bioinformatik-Methoden I, gefolgt von Protein-Protein-Interaktion, struktureller Bioinformatik und RNA-seq-Analyse in Bioinformatik-Methoden II. In Pflanzen-Bioinformatik behandeln wir 33 pflanzenspezifische Online-Tools, von Genom-Browsern über transkriptomisches Data Mining bis hin zu Promotor-/Netzwerkanalysen und anderen. Diese Spezialisierung ist für jeden modernen Pflanzenmolekularbiologen nützlich, der ein Gefühl für den unglaublichen Umfang der Daten bekommen möchte, die Forschern zur Verfügung stehen. Ein kleiner Teil der R-Programmierung wird in Bioinformatic Methods II eingeführt, aber die meisten Tools sind Webanwendungen. Es wird empfohlen, dass Sie Zugang zu einem Laptop oder einem Desktop-Computer haben, um diese zu nutzen, da sie als mobile Anwendungen auf Ihrem Telefon oder Tablet nicht funktionieren könnten.
Praktisches Lernprojekt
Die Bioinformatik-Spezialisierung für Pflanzen auf Coursera führt Sie in die Kernkompetenzen und Ressourcen der Bioinformatik ein, z.B. NCBI's Genbank, Blast, multiple Sequenzalignments, Phylogenetik in Bioinformatik-Methoden I, gefolgt von Protein-Protein-Interaktion, struktureller Bioinformatik und RNA-seq-Analyse in Bioinformatik-Methoden II. In Pflanzen-Bioinformatik behandeln wir 33 pflanzenspezifische Online-Tools, von Genom-Browsern über transkriptomisches Data Mining bis hin zu Promotor-/Netzwerkanalysen und anderen. Im letzten Kurs, dem Plant Bioinformatics Capstone, werden diese Tools eingesetzt, um eine Hypothese über die biologische Rolle eines Gens mit unbekannter Funktion aufzustellen, die in einem schriftlichen Laborbericht zusammengefasst wird.