Dans ce cours, vous suivrez les traces des bioinformaticiens qui ont enquêté sur l'épidémie de COVID-19 en assemblant le génome du SARS-CoV-2. Que vous soyez novice dans le monde de la biologie informatique ou que vous soyez un expert en bioinformatique désireux d'en apprendre davantage sur ses applications dans le cadre de la pandémie de COVID-19, ou entre les deux, ce cours est fait pour vous ! Tout au long de ce parcours, nous introduirons et expliquerons des concepts génomiques, nous vous donnerons de nombreuses occasions de mettre en pratique vos compétences et nous vous proposerons une série de problèmes dont la complexité augmentera progressivement. Ce premier cours ne traite que de l'assemblage du génome du SARS-CoV-2, mais les prochains cours de cette série exploreront les analyses bioinformatiques de suivi utilisées dans le cadre de la pandémie de COVID-19.
Piratage du COVID-19 - Cours 1 : Identification d'un agent pathogène mortel
Ce cours fait partie de Spécialisation Bioinformatique appliquée
Enseigné en Anglais
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Instructeurs : Mikhail Rayko
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Compétences que vous acquerrez
- Catégorie : Bioinformatique
- Catégorie : assemblage du génome viral
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Il y a 2 modules dans ce cours
Dans le chapitre 1, nous remonterons d'abord dans le temps pour découvrir l'histoire de l'épidémie de SRAS de 2003. Ensuite, nous nous rendrons à la fin de l'année 2019 pour découvrir les origines du SARS-CoV-2, un nouveau virus qui a fait des ravages dans le monde entier pendant la pandémie de COVID-19. Enfin, nous explorerons la biologie de ce mystérieux virus et ferons les premiers pas vers le piratage de COVID-19.
Inclus
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Au chapitre 2, nous verrons comment les technologies modernes permettent de séquencer l'ADN en petits morceaux. Ensuite, nous apprendrons à utiliser SPAdes, un outil populaire d'assemblage de génomes, pour reconstruire le génome du SARS-CoV-2 à partir de petits fragments. Enfin, nous apprendrons à utiliser QUAST pour évaluer la qualité de notre génome SARS-CoV-2 assemblé.
Inclus
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