Dans le premier module, vous découvrirez les organismes qui peuvent nous infecter et nous rendre malades : les agents pathogènes. Nous commencerons par examiner les différents types d'agents pathogènes qui existent, puis nous apprendrons ce que signifie être infectieux et ce que signifie provoquer une maladie. Ensuite, nous aborderons les différentes méthodes par lesquelles les agents pathogènes peuvent se transmettre d'une personne à l'autre, provoquant ainsi une épidémie. Vous apprendrez à connaître le nombre le plus important de toute l'épidémiologie, R0, et pourquoi ce nombre est si important. Enfin, nous apprendrons que les micro-organismes ne sont pas toujours nocifs, mais qu'ils peuvent aussi nous être bénéfiques.

Le deuxième module du cours couvre les facteurs de l'hôte qui déterminent l'issue de l'infection. Nous nous concentrerons d'abord sur l'immunité de l'hôte et présenterons à la fois les capacités immunitaires générales - la réponse immunitaire innée - qui sont encodées dans nos gènes et qui fournissent la réponse initiale à l'infection, et la réponse immunitaire adaptative, qui provient de cellules hautement spécialisées qui protègent contre un agent pathogène spécifique. Vous apprendrez ensuite comment les agents pathogènes contournent ces deux types d'immunité et examinerez d'autres facteurs qui peuvent contribuer à l'infection ou à la maladie d'un individu, notamment les facteurs génétiques, les autres microbes et l'influence des facteurs sociaux et émotionnels sur l'immunité. Nous verrons ensuite comment l'infection par un micro-organisme provoque une maladie et comment les responsables de la santé publique déterminent si une épidémie est causée par un organisme infectieux.

Le troisième module du cours couvre les facteurs écologiques qui influencent les modèles dynamiques des maladies infectieuses. Nous discuterons des conditions dans lesquelles un agent pathogène peut conduire son hôte à l'extinction. Nous verrons comment la démographie de l'hôte peut permettre à l'agent pathogène de persister dans certaines populations et pas dans d'autres. Nous verrons comment les caractéristiques de l'hôte et de l'agent pathogène interagissent pour façonner différents schémas temporels d'incidence de la maladie au niveau de la population et nous discuterons des conséquences écologiques de l'infection de plusieurs espèces d'hôtes.

L'endroit où les êtres humains vivent et la manière dont ils sont reliés les uns aux autres ont des effets importants sur la manière dont les maladies infectieuses peuvent se propager. Dans ce module, vous découvrirez quelques-uns des concepts clés de l'épidémiologie. Après avoir parcouru une histoire fascinante, nous découvrirons que les réseaux sociaux sont la "carte routière" par excellence sur laquelle les maladies peuvent se déplacer et nous verrons comment la structure du réseau peut influencer la dynamique de la maladie. Ensuite, nous aborderons trois sujets qui ont tous un impact considérable sur l'épidémiologie des maladies infectieuses : les systèmes de transport humain, la densité de la population et les "superspreaders", c'est-à-dire les individus qui peuvent propager une maladie à des dizaines, voire à des centaines d'autres personnes. Nous terminerons en identifiant les informations nécessaires à la surveillance des maladies.

Dans le module 5 du cours, vous apprendrez ce qu'est la vaccination, l'une des approches les plus courantes de la prévention des épidémies. Nous commencerons par replacer la vaccination dans le contexte des nombreux types d'interventions de santé publique qui peuvent être utilisées pour prévenir ou traiter les maladies. Vous découvrirez ensuite le développement du premier vaccin, la manière dont les vaccins agissent pour prévenir l'infection et l'impact de la vaccination sur la prévention des maladies dans le monde entier. Ensuite, vous apprendrez comment la vaccination peut protéger tous les membres de la population, même ceux qui ne sont pas vaccinés, grâce à l'"immunité collective", et comment nous pouvons utiliser la structure des réseaux sociaux au sein des populations pour parvenir plus efficacement à cette protection collective. Enfin, nous verrons comment le choix d'un individu de se faire vacciner ou non peut avoir des répercussions sur l'ensemble de la population.

Dans le module 6 du cours, vous découvrirez les mécanismes de contrôle des épidémies. Dans ces cours, nous discuterons des objectifs des mécanismes de contrôle, tels que la rupture de la chaîne de transmission, et des nombreux moyens par lesquels les animaux et les humains tentent de contrôler les épidémies. Ces moyens comprennent des interventions pharmaceutiques et non pharmaceutiques, au niveau de l'individu ou de la population. Nous décrirons des exemples de grands succès en matière d'éradication et les raisons pour lesquelles les efforts de contrôle échouent.

Dans le module 7 du cours, nous nous pencherons sur les maladies infectieuses dites émergentes. Il s'agit de maladies qui posent de nouveaux problèmes. Elles comprennent des agents infectieux nouveaux pour l'humanité, mais aussi des agents infectieux qui étaient autrefois contrôlés et qui reviennent aujourd'hui, en particulier ceux qui évoluent autour d'outils de santé publique autrefois très efficaces comme les médicaments et les vaccins. Cela signifie qu'une grande partie de la semaine sera consacrée à une discussion sur l'évolution. Nous examinerons ces maladies émergentes et nous nous demanderons d'où elles viennent et ce que l'on peut faire pour les combattre Vous découvrirez de nouvelles idées pour gérer l'évolution, ainsi que certains des défis sociétaux qui en découlent. Nous nous pencherons également sur la question connexe de savoir comment certaines maladies évoluent pour devenir plus gentilles ou plus méchantes pour leurs hôtes.

Dans ce dernier module, nous explorons le contexte mondial des épidémies. Le monde évolue rapidement, la population mondiale augmente, la vitesse des déplacements et l'ampleur de la mondialisation accentuent la pression des maladies infectieuses. Cette semaine, nous commencerons par étudier un exemple classique de maladie façonnée par les conditions de la vie moderne : le SRAS. Nous verrons comment une forte densité de population dans les villes, associée à des liens avec les maladies de la faune sauvage par l'intermédiaire des marchés, peut créer une pandémie. Nous explorerons ensuite les méthodes traditionnelles de surveillance des maladies, puis les méthodes plus récentes offertes par le web et les réseaux rendus possibles par Google, Twitter et d'autres médias sociaux. Le comportement humain, l'évolution de notre culture et de notre santé sont des éléments importants de cette vision globale. Nous nous pencherons également sur les maladies émergentes et sur le schéma mondial des maladies au cours de notre histoire récente, ainsi que sur la manière dont nous avons influencé la propagation des maladies depuis nos premiers pas en tant que voyageurs internationaux. Enfin, nous discuterons des maladies de nos plantes alimentaires et de la manière dont les modèles de propagation des maladies sont développés pour promouvoir une meilleure santé mondiale. En guise de post-scriptum, nous posons la question, si chère aux médias modernes, de savoir si nous pourrions devenir des zombies

Les vidéos accessibles dans ce module sont des réponses aux questions qui ont été posées dans les sessions précédentes de ce cours. Nous vous invitons à y jeter un coup d'œil comme ressource supplémentaire pour répondre aux questions que vous vous posez ou pour explorer des sujets qui vous intéressent.