University of California San Diego
Evolution moléculaire (Bioinformatique IV)
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Evolution moléculaire (Bioinformatique IV)

Ce cours fait partie de Spécialisation Bioinformatique

Pavel  Pevzner
Phillip Compeau

Instructeurs : Pavel Pevzner

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Il y a 6 modules dans ce cours

</p><p>Bienvenue dans notre classe!</p><p>Dans cette classe, nous examinerons les deux questions biologiques centrales suivantes (les approches informatiques nécessaires pour les résoudre sont indiquées entre parenthèses):</p><ol><li>Semaines 1-3 : Quel animal nous a donné le SRAS ? (<i>Construction d'arbres évolutifs</i>)</li><li>Semaines 4-5 : Est-ce que <em>T. rex</em> n'était qu'une grosse poule mouillée ?&nbsp ;(<em>Algorithmes combinatoires</em>)</li></ol><p>La semaine 6, vous relèverez un défi d'application en bioinformatique en appliquant des algorithmes de construction d'arbres évolutifs afin de déterminer l'origine de la récente épidémie d'ébola en Afrique.</p><p>Comme dans les cours précédents, chacun de ces deux chapitres est accompagné d'une bande dessinée sur la bioinformatique créée par le talentueux artiste Randall Christopher et servant d'en-tête de chapitre dans le best-seller de la Specializations <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">compagnon d'impression</a>. Vous trouverez la bande dessinée du premier chapitre au bas de ce message. Quel est le rapport entre les punaises et les chauves-souris, d'une part, et les virus mortels, d'autre part ? Et comment la bio-informatique peut-elle être utilisée pour stopper ces virus dans leur élan ? Commencez à apprendre dès aujourd'hui et découvrez-le!</p><p><img src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/evolution_cropped.jpg" title="Image : http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/evolution_cropped.jpg" width="528"></p>

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</p> <p>Bienvenue à la deuxième semaine de cours ! </p> <p>La semaine dernière, nous avons commencé à voir comment les arbres évolutifs peuvent être construits à partir de matrices de distance. &nbsp;Cette semaine, nous allons rencontrer d'autres algorithmes à cette fin, y compris l'algorithme de jointure entre voisins, qui est devenu l'un des dix articles les plus cités dans toute la science depuis son introduction il y a trois décennies.</p> <p>La semaine dernière, nous avons commencé à voir comment les arbres évolutifs peuvent être construits à partir de matrices de distance

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</p> <p>Bienvenue à la troisième semaine de cours ! </p> <p>Au cours des deux dernières semaines, nous avons vu plusieurs algorithmes différents pour construire des arbres évolutifs à partir de matrices de distance.</p> <p>Cette semaine, nous conclurons le chapitre actuel en examinant ce qui se passe si nous utilisons des propriétés appelées "caractères" à la place des distances. Nous verrons également comment déduire les états ancestraux des organismes dans un arbre évolutif, et nous nous demanderons s'il est possible de définir un algorithme efficace pour cette tâche.</p> <p>La semaine prochaine, nous conclurons ce chapitre en examinant ce qui se passe si nous utilisons des propriétés appelées "caractères" au lieu des distances

Inclus

4 vidéos1 lecture1 devoir2 éléments d'application

</p> <p>Bienvenue à la quatrième semaine de cours ! </p> <p>Les oiseaux ont-ils évolué à partir des dinosaures ? Au cours des deux prochaines semaines, nous verrons comment nous pourrions analyser les preuves moléculaires à l'appui de cette théorie. Vous trouverez la bande dessinée de Randall Christopher sur la bioinformatique de cette semaine au bas de cet e-mail. Pourquoi le <em>T. rex&nbsp;</em> ressemble-t-il tant à un poulet ? Et pourquoi le singe tape-t-il frénétiquement ? Continuez à apprendre pour le découvrir!</p> <p><img src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/proteomics_cropped.jpg" title="Image : http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/proteomics_cropped.jpg" width="528"></p> <p>Les dessins humoristiques de Randolph Christopher sont des illustrations de l'évolution de la science et de la technologie

Inclus

4 vidéos1 devoir2 éléments d'application

</p> <p>Bienvenue à la cinquième semaine de cours ! </p> <p>La semaine dernière, nous nous sommes demandé s'il était possible que des peptides de dinosaures survivent enfermés dans un fossile pendant 65 millions d'années. Cette semaine, nous allons voir ce que cette question a à voir avec les statistiques ; ce faisant, nous verrons comment un singe tapant des symboles sur une machine à écrire peut être utilisé pour y répondre.</p> <p>La semaine dernière, nous nous sommes demandé s'il était possible que des peptides de dinosaures survivent enfermés dans un fossile pendant 65 millions d'années

Inclus

5 vidéos1 devoir2 éléments d'application

</p> <p>Bienvenue à la sixième et dernière semaine du cours ! </p> <p>Dans le défi d'application de la bioinformatique de cette semaine, nous allons reconstruire un arbre évolutif des ébolavirus et l'utiliser pour déterminer l'origine de l'agent pathogène qui a causé la récente épidémie en Afrique.</p> <p>

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Pavel  Pevzner
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Phillip Compeau
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’Lorsque j'ai besoin de cours sur des sujets que mon université ne propose pas, Coursera est l'un des meilleurs endroits où se rendre.’
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