University of Colorado Boulder
Engineering Genetic Circuits: Modeling and Analysis

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University of Colorado Boulder

Engineering Genetic Circuits: Modeling and Analysis

Chris Myers
Lukas Buecherl

Dozenten: Chris Myers

Verschaffen Sie sich einen Einblick in ein Thema und lernen Sie die Grundlagen.
Stufe Mittel

Empfohlene Erfahrung

Es dauert 24 Stunden
3 Wochen bei 8 Stunden pro Woche
Flexibler Zeitplan
In Ihrem eigenen Lerntempo lernen
Auf einen Abschluss hinarbeiten
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Stufe Mittel

Empfohlene Erfahrung

Es dauert 24 Stunden
3 Wochen bei 8 Stunden pro Woche
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Was Sie lernen werden

  • Design and analyze models of genetic circuits.

  • Simulate genetic circuit models using ODE simulation methods.

  • Simulate genetic circuit models using stochastic simulation methods.

  • Utilize genetic technology mappers to select parts for genetic designs.

Kompetenzen, die Sie erwerben

  • Kategorie: Stochastic Simulation Analysis
  • Kategorie: Genetic Technology Mapping
  • Kategorie: Differential Equation Analysis
  • Kategorie: Genetic Circuit Models
  • Kategorie: SSA Variations

Wichtige Details

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16 Aufgaben

Unterrichtet in Englisch

Erfahren Sie, wie Mitarbeiter führender Unternehmen gefragte Kompetenzen erwerben.

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Erweitern Sie Ihre Fachkenntnisse

Dieser Kurs ist Teil der Spezialisierung Spezialisierung Engineering Genetic Circuits
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  • Lernen Sie neue Konzepte von Branchenexperten
  • Gewinnen Sie ein Grundverständnis bestimmter Themen oder Tools
  • Erwerben Sie berufsrelevante Kompetenzen durch praktische Projekte
  • Erwerben Sie ein Berufszertifikat zur Vorlage
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In diesem Kurs gibt es 5 Module

This week will describe the basics of modeling biological systems using chemical reactions, how these models can be represented using the Systems Biology Markup Language (SBML) standard, and how these models can be constructed using software tools such as iBioSim.

Das ist alles enthalten

23 Videos6 Lektüren2 Aufgaben1 peer review

This module will introduce the theory and methods for the analysis of genetic circuit models using ordinary differential equations (ODEs). In particular, it will describe the classical chemical kinetic model, numerical methods for ODE simulation of these models, and techniques to analyze these ODE models qualitatively.

Das ist alles enthalten

13 Videos3 Lektüren3 Aufgaben1 peer review

This module will introduce stochastic analysis methods for genetic circuits. In particular, it will introduce the stochastic chemical kinetics model, Gillespie's Stochastic Simulation Algorithm (SSA) to analyze these models, and various alternative stochastic analysis methods. Finally, the module will conclude with some additional topics: the Chemical Langevin Equation, stochastic Petri nets, the phage lambda model, and spatial Gillespie methods.

Das ist alles enthalten

20 Videos4 Lektüren4 Aufgaben1 peer review

This module presents several variations on the SSA algorithm to solve particular analysis problems. In particular, the hierarchical SSA (hSSA) methods enable the analysis of large models, the weighted SSA (wSSA) methods allow for the analysis of rare events, and the incremental SSA (iSSA) methods enable the determination of typical behaviors.

Das ist alles enthalten

18 Videos4 Lektüren3 Aufgaben

This module presents various ways that modeling can be utilized in genetic circuit design to select parts for optimal performance.

Das ist alles enthalten

21 Videos4 Lektüren4 Aufgaben

Dozenten

Chris Myers
University of Colorado Boulder
3 Kurse2.507 Lernende
Lukas Buecherl
University of Colorado Boulder
3 Kurse2.507 Lernende

von

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Auf einen Abschluss hinarbeiten

Dieses Kurs ist Teil des/der folgenden Studiengangs/Studiengänge, die von University of Colorado Boulderangeboten werden. Wenn Sie zugelassen werden und sich immatrikulieren, können Ihre abgeschlossenen Kurse auf Ihren Studienabschluss angerechnet werden und Ihre Fortschritte können mit Ihnen übertragen werden.¹

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Lernender seit 2018
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Jennifer J.
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Häufig gestellte Fragen