Im vorigen Kurs der Specialization haben wir gelernt, wie man Gene, Proteine und Genome vergleicht. Eine Möglichkeit, diese Methoden zu nutzen, besteht darin, einen "Baum des Lebens" zu erstellen, der zeigt, wie sich eine große Anzahl verwandter Organismen im Laufe der Zeit entwickelt hat. In der ersten Hälfte des Kurses werden wir Ansätze zur Erstellung von Evolutionsbäumen diskutieren, die Gegenstand einiger der meistzitierten wissenschaftlichen Arbeiten aller Zeiten waren, und zeigen, wie sie Rätsel lösen können, von der Suche nach dem Ursprung eines tödlichen Virus bis hin zur Suche nach dem Geburtsort des modernen Menschen. In der zweiten Hälfte des Kurses werden wir einen anderen Gang einlegen und die alte Behauptung untersuchen, dass sich Vögel aus Dinosauriern entwickelt haben. Wie können wir das beweisen? Wir werden insbesondere ein Ergebnis untersuchen, das besagt, dass Peptide, die aus einem T. rex-Fossil gewonnen wurden, eng mit Peptiden übereinstimmen, die in Hühnern gefunden wurden. Wir werden insbesondere Methoden aus der computergestützten Proteomik verwenden, um herauszufinden, wie wir beurteilen können, ob dieses Ergebnis stichhaltig ist oder auf eine Form der Kontamination zurückzuführen ist. Schließlich werden Sie lernen, wie man gängige Bioinformatik-Software-Tools anwendet, um einen Evolutionsbaum von Ebolaviren zu rekonstruieren und die Quelle der jüngsten Ebola-Epidemie zu identifizieren, die weltweit für Schlagzeilen sorgte.
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Molekulare Evolution (Bioinformatik IV)
Dieser Kurs ist Teil von Spezialisierung Bioinformatik
Dozenten: Pavel Pevzner
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In diesem Kurs gibt es 6 Module
<p>Willkommen zu unserem Kurs!</p><p>In diesem Kurs werden wir uns mit den folgenden zwei zentralen biologischen Fragen beschäftigen (die zur Lösung benötigten Rechenansätze sind in Klammern angegeben):</p><ol><li>Wochen 1-3: Welches Tier gab uns SARS? (<i>Evolutionsbaumkonstruktion</i>)</li><li>Wochen 4-5: War <em>T. rex</em> nur ein großes Huhn? (<em>Kombinatorische Algorithmen</em>)</li></ol><p>In Woche 6 werden Sie eine Bioinformatik-Anwendungsaufgabe lösen, bei der Sie Algorithmen zur Konstruktion von Evolutionsbäumen anwenden, um den Ursprung des jüngsten Ebola-Ausbruchs in Afrika zu bestimmen.</p><p>Wie in früheren Kursen wird jedes dieser beiden Kapitel von einem Bioinformatik-Cartoon begleitet, der von dem talentierten Künstler Randall Christopher erstellt wurde und als Kapitelüberschrift in dem Bestseller <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">Print Companion</a> der Specializations dient. Sie finden den Cartoon des ersten Kapitels am Ende dieser Nachricht. Was haben Stabwanzen und Fledermäuse mit tödlichen Viren zu tun? Und wie kann die Bioinformatik eingesetzt werden, um diesen Viren das Handwerk zu legen? Beginnen Sie noch heute zu lernen und finden Sie es heraus!</p><p><img src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/evolution_cropped.jpg" title="Bild: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/evolution_cropped.jpg" width="528"></p>
Das ist alles enthalten
5 Videos2 Lektüren1 Aufgabe2 App-Elemente
<p>Willkommen zu Woche 2 des Kurses!</p> <p>In der letzten Woche haben wir uns damit beschäftigt, wie Evolutionsbäume aus Distanzmatrizen konstruiert werden können. In dieser Woche werden wir weitere Algorithmen für diesen Zweck kennenlernen, darunter den Nachbarschaftsverbindungsalgorithmus, der seit seiner Einführung vor drei Jahrzehnten zu den zehn meistzitierten Arbeiten in der gesamten Wissenschaft gehört.</p>
Das ist alles enthalten
3 Videos1 Lektüre1 Aufgabe2 App-Elemente
<p>Willkommen zu Woche 3 des Kurses!</p> <p>In den letzten zwei Wochen haben wir verschiedene Algorithmen für die Konstruktion von Evolutionsbäumen aus Distanzmatrizen kennengelernt.</p> <p>In dieser Woche werden wir das aktuelle Kapitel abschließen, indem wir untersuchen, was passiert, wenn wir anstelle von Distanzen Eigenschaften verwenden, die "Charaktere" genannt werden. Wir werden auch sehen, wie man die Vorfahren von Organismen in einem Evolutionsbaum ableitet, und wir werden prüfen, ob es möglich ist, einen effizienten Algorithmus für diese Aufgabe zu definieren.</p>
Das ist alles enthalten
4 Videos1 Lektüre1 Aufgabe2 App-Elemente
<p>Willkommen zu Woche 4 des Kurses!</p> <p>Haben sich Vögel aus Dinosauriern entwickelt? In den nächsten zwei Wochen werden wir sehen, wie wir molekulare Beweise zur Unterstützung dieser Theorie analysieren können. Den Bioinformatik-Cartoon dieser Woche von Randall Christopher finden Sie unten in dieser E-Mail. Warum sieht der <em>T. rex </em> so sehr wie ein Huhn aus? Und warum tippt der Affe so hektisch? Lernen Sie weiter, um es herauszufinden!</p> <p><img src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/proteomics_cropped.jpg" title="Bild: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/proteomics_cropped.jpg" width="528"></p>
Das ist alles enthalten
4 Videos1 Aufgabe2 App-Elemente
<p>Willkommen zu Woche 5 des Kurses!</p> <p>Letzte Woche haben wir uns die Frage gestellt, ob es möglich ist, dass Dinosaurierpeptide 65 Millionen Jahre lang in einem Fossil eingeschlossen überleben. In dieser Woche werden wir sehen, was diese Frage mit Statistik zu tun hat; dabei werden wir sehen, wie ein Affe, der Symbole auf einer Schreibmaschine tippt, zur Beantwortung dieser Frage eingesetzt werden kann.</p>
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5 Videos1 Aufgabe2 App-Elemente
<p>Willkommen zur sechsten und letzten Woche des Kurses!</p> <p>In der Bioinformatik-Anwendungsherausforderung dieser Woche werden wir einen Evolutionsbaum der Ebolaviren rekonstruieren und ihn verwenden, um den Ursprung des Erregers zu bestimmen, der den jüngsten Ausbruch in Afrika verursacht hat.</p>
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1 peer review
Dozenten
Empfohlen, wenn Sie sich für Gesundheitsinformatik interessieren
American Museum of Natural History
Johns Hopkins University
Rice University
University of California San Diego
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Geprüft am 23. Okt. 2019
Geprüft am 20. Juli 2019
Geprüft am 19. Juli 2017
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