King Abdullah University of Science and Technology
Fundamental Skills in Bioinformatics

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Fundamental Skills in Bioinformatics

Jesper Tegner
Zafer Ali
Vincenzo Lagani

Instructeurs : Jesper Tegner

9 136 déjà inscrits

Inclus avec Coursera Plus

Obtenez un aperçu d'un sujet et apprenez les principes fondamentaux.
4.4

(51 avis)

niveau Débutant

Expérience recommandée

24 heures pour terminer
3 semaines à 8 heures par semaine
Planning flexible
Apprenez à votre propre rythme
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Ce que vous apprendrez

  • Basics of R

  • Basics of Python

  • How to analyze bulk RNAseq count data

  • How to analyze single cell RNAseq count data

Compétences que vous acquerrez

  • Catégorie : Bioinformatics
  • Catégorie : Python Programming
  • Catégorie : R Programming

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13 devoirs

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Il y a 4 modules dans ce cours

The first module will explore the basics of programming through R and this will include: working in R and RStudio, understanding data types, loops and ifs. Additionally, the module will provide an introduction to RMarkDown as a tool for sharing code that we will use in the coding lectures.

Inclus

17 vidéos2 lectures4 devoirs

The second module will focus on two aims. Firstly, to master the use of logical values and vectors and its applications in quality control. Secondly, to practice the programming skills while learning how to perform basic statistical analysis. This will include: explorative data analysis, correlation, linear models, T-test, and ANOVA. Finally, we will explore the available resources for R programming.

Inclus

20 vidéos1 lecture2 devoirs6 devoirs de programmation

The third module will provide the basics of the Python programming language. First, the module will compare Python and R language and learn the programming syntax of Python. Second, the module will work with two key Python modules: pandas and numpy.

Inclus

19 vidéos1 lecture4 devoirs4 devoirs de programmation1 laboratoire non noté

The final module will focus on applying knowledge and understanding of programming in the analysis of real RNA-seq data. R will be used for analysing of bulk RNA-seq and Python for single- cell RNA-seq. The results of both analyses will then be integrated. Finally, the module will provide insights in how to gain deeper knowledge and skills in R.

Inclus

19 vidéos2 lectures3 devoirs4 devoirs de programmation

Instructeurs

Évaluations de l’enseignant
4.8 (15 évaluations)
Jesper Tegner
King Abdullah University of Science and Technology
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