Ce cours propose des démonstrations et des exercices permettant d'effectuer des tâches courantes d'analyse de données de séquences bactériennes basées sur la génomique. Il utilise BV-BRC, le Bacterial and Viral Bioinformatics Resource Center (fusion de PATRIC, IRD et ViPR, les trois anciennes ressources), comme plateforme d'analyse. BV-BRC est le centre de ressources bioinformatiques bactériennes financé par le NIH/NIAID, qui fournit des données génomiques bactériennes complètes avec des outils d'analyse et de visualisation intégrés. BV-BRC fournit également un espace de travail privé où les utilisateurs peuvent télécharger et analyser leurs propres données. Les participants au cours acquerront les compétences nécessaires pour effectuer une analyse comparative des génomes bactériens, en commençant par les données de séquence brutes. Les leçons du premier module couvrent l'assemblage du génome, l'annotation, la construction de l'arbre phylogénétique et les comparaisons entre familles de protéines et protéomes. Les leçons du premier module couvrent l'assemblage du génome, l'annotation, la construction de l'arbre phylogénétique et les comparaisons entre familles de protéines et protéomes. NOTE : Les exercices de ce cours ont été développés à l'aide de PATRIC, le système prédécesseur de BV-BRC. Cependant, BV-BRC a été construit à partir de PATRIC, donc la plupart du contenu est encore le même.

Bioinformatique bactérienne

305 avis
Expérience recommandée
Ce que vous apprendrez
Apprenez à assembler un génome bactérien
Apprenez à annoter un génome bactérien
Apprenez à générer un arbre phylogénétique à partir d'un ensemble de génomes bactériens
Apprenez à effectuer des analyses comparatives de base d'un ensemble de génomes bactériens
Compétences que vous acquerrez
- Catégorie : Visualisation scientifique
- Catégorie : Importation/exportation de données
- Catégorie : Taxonomie
- Catégorie : Bioinformatique
- Catégorie : Logiciel d'analyse de données
Détails à connaître
8 devoirs
Découvrez comment les employés des entreprises prestigieuses maîtrisent des compétences recherchées

Il y a 8 modules dans ce cours
Instructeur

Offert par
En savoir plus sur Informatique de santé

Birla Institute of Technology & Science, Pilani

Technical University of Denmark (DTU)

University of Toronto

University of Toronto
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Felipe M.

Jennifer J.

Larry W.

Chaitanya A.
Avis des étudiants
- 5 stars
78,03 %
- 4 stars
16,39 %
- 3 stars
2,95 %
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1,63 %
- 1 star
0,98 %
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Révisé le 6 févr. 2024
It is really good...got to learn more about health informatics
Révisé le 4 avr. 2025
I have learnt so much from this course, although I am yet to complete it. Thumps up to Rebecca Wattam and PATRIC.org
Révisé le 23 déc. 2020
very useful course , can solve a lot of problem in bacterium genome analysis easily

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