Researcher's guide to omic fundamentals

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Researcher's guide to omic fundamentals

Name: Researcher's guide to omic fundamentals
Rating: 3.8421052631578942 (19 reviews)

Ce cours fait partie de Spécialisation "Researcher's Guide to Omic Data"

Instructeur : Candace Savonen, MS

1 962 déjà inscrits

Inclus avec

5 modules

Obtenez un aperçu d'un sujet et apprenez les principes fondamentaux.

19 avis

niveau Intermédiaire

Expérience recommandée

4 heures à compléter

Planning flexible

Apprenez à votre propre rythme

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Ce que vous apprendrez

By the end of the course you will confidently be able to use tutorials and resources to understand and interpret your genomic data.

Compétences que vous acquerrez

Catégorie : Bioinformatics
Catégorie : Data Processing
Catégorie : Data Analysis
Catégorie : Data Analysis Software
Catégorie : Data Literacy
Catégorie : Metadata Management

Outils que vous découvrirez

Catégorie : R Programming

Détails à connaître

Certificat partageable

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Évaluations

15 devoirs

Enseigné en Anglais

91% of learners achieved a positive career outcome

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Il y a 5 modules dans ce cours

The course is intended for students in the biomedical sciences and researchers who have been given data and don’t know what to do with it or would like an overview of the different genomic data types that are out there.

This course is written for individuals who: - Have genomic data and don’t know what to do with it. - Want a basic overview of genomic data types. - Want to find resources for processing and interpreting genomics data. Goal of this course: Equip learners with tutorials and resources so they can understand and interpret their genomic data in a way that helps them meet their goals and handle the data properly. This includes helping learners formulate questions they will need to ask others about their data What is not the goal Teach learners about choosing parameters or about the ins and outs of every genomic tool they might be interested in. This course is meant to connect people to other resources that will help them with the specifics of their genomic data and help learners have more efficient and fruitful discussions about their data with bioinformatic experts. The course is intended for students in the biomedical sciences who have been given data and don’t know what to do with it or would like an overview of the different genomic data types that are out there.

In this module, we cover the basics of what will be covered in this course and what you should expect. Next we get into an overview of what omic data types and their workflows often look like.

Inclus

3 vidéos3 lectures2 devoirs1 sujet de discussion

3 vidéosTotal 5 minutes

Welcome!2 minutes
Intro to this course1 minute
Summary: Overview of genomic workflows2 minutes

3 lecturesTotal 15 minutes

Introduction5 minutes
Video Review of What is a Genome5 minutes
A very general overview of genomic data 5 minutes

2 devoirsTotal 11 minutes

A very general overview of genomic data 6 minutes
A very general overview of genomic data5 minutes

1 sujet de discussionTotal 10 minutes

What are your goals for this course?10 minutes

In this module, we cover some considerations for how to choose between different omics tools. Then we talk about what is metadata and how do you make sure you get the most of your metadata?

Inclus

2 vidéos2 lectures4 devoirs2 sujets de discussion

2 vidéosTotal 3 minutes

Summary: Considerations for choosing tools1 minute
Summary: Guidelines for Good Metadata2 minutes

2 lecturesTotal 10 minutes

Considerations for choosing tools5 minutes
Guidelines for Good Metadata5 minutes

4 devoirsTotal 37 minutes

Considerations for choosing tools15 minutes
Guidelines for Good Metadata12 minutes
Considerations for choosing tools5 minutes
Guidelines for Good Metadata5 minutes

2 sujets de discussionTotal 10 minutes

Considerations for your project5 minutes
Good Metadata Manuscript5 minutes

In this module, we build on the previous module's generalities about omic data and get into specifics about sequencing data and microarray data.

Inclus

2 vidéos2 lectures4 devoirs

2 vidéosTotal 5 minutes

Summary: Fundamentals of Sequencing Data2 minutes
Summary: Fundamentals of Microarray Data3 minutes

2 lecturesTotal 17 minutes

Sequencing Data10 minutes
Fundamentals of Microarray Data7 minutes

4 devoirsTotal 36 minutes

Sequencing Data20 minutes
Fundamentals of Microarray Data6 minutes
Sequencing Data5 minutes
Fundamentals of Microarray Data5 minutes

In this module, we discuss what are general data analysis tools you may want to consider using. Lastly we cover some basics about annotation that are involved in every omic data analysis workflow.

Inclus

1 vidéo3 lectures4 devoirs

Now that you've learned some fundamentals about omic data, in this section we have a final quiz that tests your absorption of what we've discussed. We also have a Tool Glossary of recommended tools you may want to consider using for your next steps with your omic data.

Inclus

1 vidéo2 lectures1 devoir

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