Wir werden Berechnungsmethoden - Algorithmen und Datenstrukturen - für die Analyse von DNA-Sequenzierungsdaten kennenlernen. Wir werden ein wenig über DNA, Genomik und die Verwendung von DNA-Sequenzierung lernen. Wir werden Python verwenden, um die wichtigsten Algorithmen und Datenstrukturen zu implementieren und um echte Genome und DNA-Sequenzierungsdatensätze zu analysieren.
Algorithmen für die DNA-Sequenzierung
Algorithmen für die DNA-Sequenzierung
Dieser Kurs ist Teil von Spezialisierung Genomische Datenwissenschaft
Dozenten: Ben Langmead, PhD
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- Kategorie: Bioinformatik-Algorithmen
- Kategorie: Algorithmen
- Kategorie: Python-Programmierung
- Kategorie: Algorithmen auf Zeichenketten
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8 Aufgaben
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In diesem Kurs gibt es 4 Module
In diesem Modul beginnen wir mit der Erforschung von Algorithmen zur Analyse von DNA-Sequenzierungsdaten. Wir besprechen die DNA-Sequenzierungstechnologie, ihre Vergangenheit und Gegenwart und wie sie funktioniert
Das ist alles enthalten
19 Videos7 Lektüren2 Aufgaben
In diesem Modul lernen wir nützliche und flexible neue Algorithmen zur Lösung von exakten und approximativen Matching-Problemen kennen. Zunächst lernen wir Boyer-Moore kennen, einen schnellen und sehr weit verbreiteten Algorithmus für exakte Übereinstimmungen
Das ist alles enthalten
15 Videos1 Lektüre2 Aufgaben
In dieser Woche schließen wir unsere Diskussion über Read Alignment ab, indem wir Algorithmen kennenlernen, die sowohl das Editierabstands-Problem als auch verwandte Probleme der Biosequenzanalyse, wie das globale und lokale Alignment, lösen.
Das ist alles enthalten
13 Videos1 Lektüre2 Aufgaben
Im letzten Modul haben wir mit der Diskussion über das Ausrichtungsproblem begonnen und ein paar grundlegende Prinzipien kennengelernt. In diesem Modul lernen wir ein paar Möglichkeiten kennen, das Ausrichtungsproblem zu lösen.
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13 Videos1 Lektüre2 Aufgaben
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Felipe M.
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NF
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Geprüft am 9. März 2021
very engaging and well-presented course material.
SS
5
Geprüft am 3. Juli 2018
Very well prepared, from basics up to all commonly used techniques in bioinformatics. Prerequisites in Python is a plus, but not even necessary.
VK
5
Geprüft am 7. Aug. 2017
This course provided me a very quick overview of all the core concepts pertaining to DNA sequencing. It is very well organized, crystal clear demonstration of concepts and I really enjoyed the course.
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