Dieser Kurs behandelt Ansätze für die Modellierung der Behandlung von Infektionskrankheiten sowie für die Modellierung von Impfungen. Aufbauend auf dem SIR-Modell lernen Sie, wie Sie zusätzliche Kompartimente einbeziehen können, um die Auswirkungen von Interventionen darzustellen, z.B. die Auswirkungen von Impfungen auf die Verringerung der Anfälligkeit. Sie lernen etwas über "undichte" Impfstoffe und wie man sie modelliert, sowie über verschiedene Arten von Impfstoff- und Behandlungseffekten. Es ist wichtig, die grundlegenden Beziehungen zwischen Modellen und Daten zu berücksichtigen. Daher werden Sie das in Kurs 1 entwickelte SIR-Basismodell auf epidemische Daten kalibrieren. Die manuelle Durchführung einer solchen Kalibrierung wird Ihnen helfen zu verstehen, wie die Modellparameter angepasst werden können, um reale Daten zu erfassen. Schließlich lernen Sie in diesem Kurs zwei einfache Ansätze zur computergestützten Modellkalibrierung kennen - den Least-Squares-Ansatz und den Maximum-Likelihood-Ansatz; Sie werden Modellkalibrierungen nach jedem dieser Ansätze in R durchführen.
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Interventionen und Kalibrierung
Dieser Kurs ist Teil von Spezialisierung Modellierung von Infektionskrankheiten
Dozent: Nimalan Arinaminpathy
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Was Sie lernen werden
Identifizieren Sie die Beziehung zwischen Modellen und realen epidemiologischen Daten
Einbeziehung der Behandlung oder Impfung in ein SIR-Modell unter Berücksichtigung der unvollkommenen Wirksamkeit und der verschiedenen Wirkmechanismen
Führen Sie einfache Kalibrierungen eines SIR-Modells anhand von Zeitreihendaten durch und wählen Sie dabei Parameter aus, um die Anpassung des Modells an die Daten zu maximieren
Erkennen Sie zwei einfache Ansätze zur computergestützten Modellkalibrierung und führen Sie Modellkalibrierungen nach jedem dieser Ansätze in R durch.
Kompetenzen, die Sie erwerben
- Kategorie: Mathematisches Modell
- Kategorie: Infektionskrankheiten
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In diesem Kurs gibt es 4 Module
Sobald Sie die grundlegende Dynamik der Übertragung mithilfe einfacher mathematischer Modelle erfasst haben, können Sie diese Modelle nutzen, um die Auswirkungen verschiedener Maßnahmen zu simulieren. Sie werden Ansätze für die Modellierung der Behandlung von Infektionskrankheiten sowie für die Modellierung von Impfungen untersuchen. Aufbauend auf dem SIR-Modell werden Sie lernen, wie Sie zusätzliche Kompartimente einbeziehen können, um die Auswirkungen von Interventionen darzustellen (z.B. die Wirkung von Impfungen bei der Verringerung der Anfälligkeit). Sie lernen etwas über "undichte" Impfstoffe und wie man sie modelliert, sowie über verschiedene Arten von Impfstoff- und Behandlungseffekten.
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5 Videos5 Lektüren2 Diskussionsthemen11 Unbewertete Labore
Alle Modelle zur Beantwortung von Fragen der öffentlichen Gesundheit müssen zunächst mit realen Daten abgeglichen oder "kalibriert" werden, um sicherzustellen, dass die modellsimulierte Dynamik mit den beobachteten Daten übereinstimmt. In diesem Modul werden Sie die grundlegenden Beziehungen zwischen Modellen und Daten betrachten. Anhand des grundlegenden SIR-Modells, das Sie bisher entwickelt haben, werden Sie dieses Modell auf epidemische Daten kalibrieren. Indem Sie diese Kalibrierung von Hand durchführen, lernen Sie, wie die Modellparameter angepasst werden können, um reale Daten zu erfassen.
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4 Videos1 Diskussionsthema4 Unbewertete Labore
In der Praxis wird die Modellkalibrierung für kompartimentäre Modelle selten von Hand vorgenommen. Vielmehr konstruieren wir eine Funktion, die die Anpassungsgüte zwischen dem Modell und den Daten zusammenfasst, und verwenden dann verfügbare Computeralgorithmen, um diese Anpassungsgüte zu maximieren. In den nächsten beiden Modulen lernen Sie zwei einfache Ansätze zur computergestützten Modellkalibrierung kennen: den Least-Squares-Ansatz und den Maximum-Likelihood-Ansatz. Sie werden Modellkalibrierungen mit jedem dieser Ansätze in R durchführen.
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3 Videos6 Unbewertete Labore
Bitte beachten Sie, dass die Lernergebnisse in diesem und im letzten Modul identisch sind. In der Praxis wird die Modellkalibrierung für kompartimentäre Modelle selten von Hand durchgeführt. Vielmehr konstruieren wir eine Funktion, die die Anpassungsgüte zwischen dem Modell und den Daten zusammenfasst und verwenden dann verfügbare Computeralgorithmen, um diese Anpassungsgüte zu maximieren. In diesen beiden Modulen lernen Sie zwei einfache Ansätze zur computergestützten Modellkalibrierung kennen: den Least-Squares-Ansatz und den Maximum-Likelihood-Ansatz. Sie werden Modellkalibrierungen mit jedem dieser Ansätze in R durchführen.
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4 Videos1 Lektüre2 Aufgaben4 Unbewertete Labore
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