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The University of Melbourne
Contrôle épigénétique de l'expression génétique
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The University of Melbourne

Contrôle épigénétique de l'expression génétique

Dr. Marnie Blewitt

Instructeur : Dr. Marnie Blewitt

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Il y a 7 modules dans ce cours

Si la séquence du génome humain a transformé notre compréhension de la biologie humaine, ce n'est pas seulement la séquence de votre ADN qui compte, mais aussi la manière dont vous l'utilisez ! Comment certains gènes sont-ils activés et d'autres réduits au silence ? Comment cela est-il contrôlé ? La réponse est l'épigénétique.

L'épigénétique est un sujet de recherche brûlant depuis une dizaine d'années, car il est devenu évident qu'un contrôle épigénétique aberrant contribue à la maladie (en particulier au cancer). Les altérations épigénétiques sont héréditaires au cours de la division cellulaire et, dans certains cas, peuvent se comporter de manière similaire aux mutations en termes de stabilité. Il est important de noter que, contrairement aux mutations génétiques, les modifications épigénétiques sont réversibles et peuvent donc être manipulées à des fins thérapeutiques. Ces dernières années, il est également apparu clairement que les modifications épigénétiques sont sensibles à l'environnement (par exemple à l'alimentation), ce qui a suscité un grand nombre de débats publics et de recherches. Ce cours présentera une introduction aux principes fondamentaux du contrôle épigénétique. Nous examinerons les phénomènes épigénétiques qui sont des manifestations du contrôle épigénétique dans plusieurs organismes, en mettant l'accent sur les mammifères. Nous examinerons l'interaction entre le contrôle épigénétique et l'environnement et enfin le rôle d'un contrôle épigénétique aberrant dans la maladie. Toutes les informations nécessaires seront couvertes dans les cours magistraux, et des lectures recommandées et obligatoires seront fournies. Il n'y a pas de textes supplémentaires requis pour ce cours. Pour les personnes intéressées, des informations supplémentaires peuvent être obtenues dans le manuel suivant : Epigenetics. Allis, Jenuwein, Reinberg et Caparros. Cold Spring Harbour Laboratory Press. ISBN-13 : 978-0879697242 | Edition : 1 Le cours sera réouvert en 2022.

Introduction et définition du contrôle épigénétique de l'expression des gènes et de son importance dans le développement normal. Nous apprendrons ce qu'est la chromatine et comment sa composition et son conditionnement peuvent modifier l'expression des gènes. Nous discuterons également de la modification épigénétique la mieux caractérisée, la méthylation de l'ADN, et de son rôle non seulement dans la régulation de l'expression des gènes, mais aussi dans le maintien de la stabilité du génome.

Inclus

7 vidéos5 lectures1 devoir

7 vidéos•Total 64 minutes
  • Aperçu du cours•1 minute
  • 1.1 Introduction aux concepts du contrôle épigénétique•10 minutes
  • 1.2 Héritabilité mitotique des marques épigénétiques•10 minutes
  • 1.3 La chromatine et le nucléosome•6 minutes
  • 1.4 Compaction de la chromatine - hétérochromatine contre euchromatine•9 minutes
  • 1.5 Méthylation de l'ADN au niveau des îlots CpG•11 minutes
  • 1.6 Méthylation de l'ADN dans les régions intergéniques et les éléments répétitifs•15 minutes
5 lectures•Total 50 minutes
  • Plan du cours•10 minutes
  • L'équipe enseignante•10 minutes
  • Enquête de début de cours•10 minutes
  • Politique d'évaluation et de notation•10 minutes
  • Ressources des semaines 1 et 2•10 minutes
1 devoir•Total 30 minutes
  • Questionnaire de la semaine 1 - contribue à hauteur de 8 % à votre note finale•30 minutes

Nous examinerons en détail les mécanismes moléculaires de régulation de l'expression génétique, depuis la façon dont l'ADN est emballé au niveau local jusqu'à la façon dont la chromatine est positionnée dans le noyau. Nous découvrirons les modifications de la chromatine impliquées dans l'extinction et l'activation des gènes, le rôle de l'ARN non codant et les structures chromatiniennes d'ordre supérieur. Cette semaine vous permettra de bien comprendre les mécanismes de base qui vous aideront à comprendre les processus que nous aborderons dans le reste du cours.

Inclus

9 vidéos1 lecture1 devoir

9 vidéos•Total 90 minutes
  • 2.1 Introduction aux modifications de la queue des histones•4 minutes
  • 2.2 Acétylation et méthylation des histones•12 minutes
  • 2.3 Remodelage de la chromatine•12 minutes
  • 2.4 Variantes d'histones•8 minutes
  • 2.5 ARN non codants - microARN•6 minutes
  • 2.6 ARN non codants - piRNA•9 minutes
  • 2.7 ARN non codants - ARN non codants longs introduction•10 minutes
  • 2.8 ARN longs non codants Xist et HOTAIR•7 minutes
  • 2.9 Organisation 3D du noyau et résumé des marques épigénétiques•17 minutes
1 lecture•Total 10 minutes
  • Ressources des semaines 1 et 2•10 minutes
1 devoir•Total 30 minutes
  • Questionnaire de la semaine 2 - contribue à hauteur de 8 % à votre note finale•30 minutes

L'inactivation du chromosome X est un processus épigénétique très bien caractérisé qui est maintenant utilisé comme système modèle pour étudier les processus épigénétiques qui sont pertinents de manière plus générale. En effet, ce processus fait appel à de nombreux mécanismes épigénétiques, à de nombreux niveaux, pour parvenir à l'inactivation stable d'un chromosome entier. Nous découvrirons ce processus et la manière dont il se déroule chez la souris dans les moindres détails, ce qui permettra d'approfondir les connaissances mécanistiques acquises au cours de la deuxième semaine. Nous aborderons ensuite brièvement d'autres mécanismes de compensation de la dose qui existent dans d'autres organismes.

Inclus

12 vidéos1 lecture1 devoir

12 vidéos•Total 113 minutes
  • 3.1 Histoire et contexte de l'inactivation du chromosome X•13 minutes
  • 3.2 Chronologie de l'inactivation des chromosomes X aléatoires et imprimés•8 minutes
  • 3.3 Étapes de l'inactivation du X - comptage et contrôle de l'expression du Xist•13 minutes
  • 3.4 Contrôle de l'expression de Xist par des facteurs de pluripotence•6 minutes
  • 3.5 étapes de l'inactivation du X - choix du X à inactiver•9 minutes
  • 3.6 Étapes de l'inactivation du X - initiation et propagation du silencing•11 minutes
  • 3.7 Étapes de l'inactivation du X - mise en place du silencieux•6 minutes
  • 3.8 Stades de l'inactivation du X - maintien du silencieux, par exemple Dnmt1•8 minutes
  • 3.9 Stades d'inactivation du X - maintien du silencieux, par exemple Smchd1•8 minutes
  • 3.10 Résumé de l'inactivation du chromosome X•10 minutes
  • 3.11 Compensation de la dose chez les mouches et les vers, par rapport aux mammifères•8 minutes
  • 3.12 Leçons tirées de la mouche - panachure à effet de position et dépistage des modificateurs épigénétiques•10 minutes
1 lecture•Total 10 minutes
  • Ressources de la semaine 3 (y compris les lectures obligatoires)•10 minutes
1 devoir•Total 30 minutes
  • Questionnaire de la semaine 3 - contribue à hauteur de 12 % à votre note finale•30 minutes

Nous découvrirons les deux périodes importantes du développement pour l'effacement et la réinitialisation de l'épigénome. Deux caractéristiques bien caractérisées sont traitées différemment au cours de la reprogrammation épigénétique : les gènes imprimés et les répétitions. Nous découvrirons les mécanismes de l'empreinte génomique et étudierons trois exemples de manière plus approfondie.

Inclus

6 vidéos1 lecture1 devoir

6 vidéos•Total 67 minutes
  • 4.1 Introduction à la reprogrammation épigénétique des génomes maternel et paternel•9 minutes
  • 4.2 Reprogrammation épigénétique des gènes à empreinte et des éléments répétitifs•11 minutes
  • 4.3 Localisation des gènes imprimés dans le génome et séquençage au bisulfite•10 minutes
  • 4.4 Mécanismes d'action des ICR Kcnq1 et H19/Igf2 et syndrome de Beckwith Weidemann•17 minutes
  • 4.5 Mécanisme ICR Snrpn, syndromes de Prader Willi et d'Angelman•13 minutes
  • 4.6 Résumé de la reprogrammation épigénétique et de l'empreinte•6 minutes
1 lecture•Total 10 minutes
  • Ressources de la semaine 4 (y compris les lectures obligatoires)•10 minutes
1 devoir•Total 30 minutes
  • Questionnaire de la semaine 4 - contribue à hauteur de 12 % à votre note finale•30 minutes

Nous commençons à examiner quelques-uns des grands domaines d'intérêt de l'épigénétique humaine, notamment l'influence de l'environnement sur l'épigénome, la reprogrammation des cellules somatiques en cellules souches, le clonage et l'éventuelle transmission transgénérationnelle de l'épigénome. Nous discuterons de ce que l'on sait de l'évolution de l'épigénome au cours de ces processus et nous examinerons quelques études de cas fondamentales.

Inclus

6 vidéos1 lecture1 devoir

6 vidéos•Total 89 minutes
  • 5.1 Reprogrammation épigénétique perturbée dans les techniques de procréation assistée•15 minutes
  • 5.2 Reprogrammation épigénétique perturbée dans la reprogrammation et le clonage des cellules somatiques•15 minutes
  • 5.3 Introduction de l'héritage épigénétique transgénérationnel, des effets de l'environnement et des périodes sensibles dans le contrôle épigénétique•9 minutes
  • 5.4 La famine hollandaise : études épidémiologiques humaines et origines développementales de la santé et de la maladie chez l'adulte•9 minutes
  • 5.5 Études épidémiologiques humaines sur la cohorte Overkalix, effets grand-parentaux et possibilité d'une transmission épigénétique transgénérationnelle chez l'homme•12 minutes
  • 5.6 Conférence de vulgarisation : Entretien avec le Dr Andrew Keniry•26 minutes
1 lecture•Total 10 minutes
  • Ressources de la semaine 5 (y compris les lectures obligatoires)•10 minutes
1 devoir•Total 30 minutes
  • Interrogation de la semaine 5 - contribue à hauteur de 12 % à votre note finale•30 minutes

Un regard sur les mécanismes qui sous-tendent certaines des observations que nous avons discutées dans la semaine 5, à travers l'étude d'organismes modèles. Nous découvrirons les épialles métastables, qui ont permis l'étude de l'épigénétique transgénérationnelle chez la souris et fourni des preuves de l'épigénétique transgénérationnelle chez les mammifères.

Inclus

8 vidéos1 lecture1 devoir

8 vidéos•Total 101 minutes
  • 6.1 Études sur les souris et les rats concernant les effets paternels de l'exposition aux produits chimiques, les effets du comportement maternel sur la constitution épigénétique•14 minutes
  • 6.2 L'héritage épigénétique transgénérationnel via les gamètes•10 minutes
  • 6.3 L'allèle jaune viable Agouti chez la souris•15 minutes
  • 6.4 Effets de l'environnement sur l'allèle jaune viable de l'Agouti•11 minutes
  • 6.5 L'allèle fusionné Axin chez la souris et les épialles métastables•14 minutes
  • 6.6 Mécanismes potentiels de l'héritage épigénétique transgénérationnel : reprogrammation épigénétique incomplète•9 minutes
  • 6.7 Paramutation chez les plantes et effets similaires à la paramutation chez les souris•13 minutes
  • 6.8 Épimutation constitutionnelle chez l'homme - pas d'héritage épigénétique transgénérationnel•12 minutes
1 lecture•Total 10 minutes
  • Ressources de la semaine 6 (y compris les lectures obligatoires)•10 minutes
1 devoir•Total 20 minutes
  • Questionnaire de la semaine 6 - contribue à hauteur de 12 % à votre note finale•20 minutes

Cette semaine, nous allons rassembler une grande partie de ce que nous avons appris au cours des semaines précédentes pour comprendre comment l'épigénome est affecté, et peut également affecter, le développement et la progression du cancer. Nous discuterons ensuite des avantages thérapeutiques potentiels qui peuvent découler de l'utilisation de biomarqueurs épigénétiques et du ciblage des modificateurs épigénétiques dans le cancer.

Inclus

11 vidéos3 lectures1 évaluation par les pairs

11 vidéos•Total 143 minutes
  • 7.1 Aperçu de l'épigénétique du cancer•7 minutes
  • 7.2 Hyperméthylation des îlots CpG dans le cancer•16 minutes
  • 7.3 Hyperméthylation d'ensembles d'îlots CpG dans le cancer•11 minutes
  • 7.4 Hypométhylation à l'échelle du génome dans le cancer•12 minutes
  • 7.5 Modifications des histones dans le cancer•11 minutes
  • 7.6 Modifications épigénétiques à long terme dans le cancer et altérations de l'architecture nucléaire•10 minutes
  • 7.7 Expression altérée des piRNA et des longs ARN non codants dans le cancer•9 minutes
  • 7.8 Mutations des modificateurs épigénétiques dans le cancer•9 minutes
  • 7.9 Médicaments ciblant la machinerie épigénétique en tant que chimiothérapies•17 minutes
  • 7.10 Conférence de vulgarisation : Vieillissement - Partie 1•14 minutes
  • 7.11 Conférence sur l'extension : Vieillissement - Partie 2•23 minutes
3 lectures•Total 30 minutes
  • Ressources de la semaine 7 (y compris les lectures obligatoires)•10 minutes
  • Intégrité académique•10 minutes
  • Enquête de fin de cours•10 minutes
1 évaluation par les pairs•Total 120 minutes
  • Epigénétique et cancer - contribue à hauteur de 36% à votre note finale•120 minutes

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Instructeur

Évaluations de l’enseignant

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4.8 (144 évaluations)
Dr. Marnie Blewitt
Dr. Marnie Blewitt
The University of Melbourne
1 Cours•52 361 apprenants

Offert par

The University of Melbourne

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The University of Melbourne

L'université de Melbourne est une université de recherche intensive internationalement reconnue, avec une forte tradition d'excellence dans l'enseignement, la recherche et l'engagement communautaire. Fondée en 1853, elle est la deuxième plus ancienne université d'Australie.

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    Johns Hopkins University

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    K

    Korea Advanced Institute of Science and Technology(KAIST)

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    Prévisualisation
    J

    Johns Hopkins University

    Bioinformatics Methods for Transcriptomics

    Cours

  • Statut : Prévisualisation
    Prévisualisation
    U

    University of Geneva

    Precision Medicine

    Cours

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Avis des étudiants

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830 avis

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Affichage de 3 sur 830

A
AL
5

Révisé le 10 déc. 2016

Excellent course by an expert in the field. Full appreciation requires a background in biochemistry and genetics, but still a lot can be learned by anyone with interest.

L
LM
5

Révisé le 18 juin 2016

The course is very interesting for those who like Genetics. The lectures are delivered in an understandable manner, and the motion pictures make everything clear right away.

H
HK
5

Révisé le 16 nov. 2018

This course is well taught and some important concepts are repeated over and over again during the course so the concept lingers in the brain as if it was there already.

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