This course introduces how to perform abstraction of genetic circuit models. The first module teaches reaction-based abstraction methods that apply steady-state approximations to reduce the complexity and improve the analysis time of these models. The second module describes piecewise approximations to simplify non-linear reaction-based models of genetic circuits. The third module presents Markov chain models and methods for analyzing them. The fourth module provides methods to abstract models even further using state-based abstraction methods. Finally, the fifth module demonstrates methods, such as infinite-state stochastic model checking, to determine the likelihood that a genetic circuit hazard will cause circuit failure.
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Engineering Genetic Circuits: Abstraction Methods
Ce cours fait partie de Spécialisation Engineering Genetic Circuits
Instructeurs : Chris Myers
Inclus avec
Expérience recommandée
Ce que vous apprendrez
Derive abstracted reaction-based models of genetic circuits.
Utilize piecewise models of genetic circuits.
Perform analysis of Markov chain models.
Construct state-based abstracted models of genetic circuits.
Compétences que vous acquerrez
- Catégorie : Reaction-Based Abstraction Methods
- Catégorie : Piecewise Models
- Catégorie : Infinite-State Stochastic Model Checking Methods
- Catégorie : State-Based Abstraction Methods
- Catégorie : Markov Chain Analysis
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juillet 2024
12 devoirs
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Il y a 5 modules dans ce cours
This module will introduce methods to simplify chemical reaction models using automated model abstraction techniques.
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This module will introduce methods for abstracting models using piecewise linear representations.
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Instructeurs
Offert par
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Johns Hopkins University
Arizona State University
University of Colorado Boulder
Georgia Institute of Technology
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