Ce cours couvre la science et les impacts sociaux des maladies infectieuses virales. Nous commencerons par aborder les bases : ce qu'est un virus, la diversité structurelle et fonctionnelle des virus, et comment les virus utilisent notre corps et celui d'autres organismes pour se répliquer. Nous nous pencherons ensuite sur la réponse humaine : comment notre système immunitaire fonctionne pour nous protéger des virus pathogènes et comment nous utilisons la science et les systèmes sociaux pour lutter contre les virus au moyen de vaccins et de mesures de santé publique. Nous étudierons de près la pandémie de COVID-19, en examinant l'émergence du virus SARS-CoV-2, le développement des vaccins et la manière dont les disparités sociales et économiques ont influencé le risque pendant la pandémie. Tout au long du cours, nous entendrons des experts dans les domaines de la biologie moléculaire, de l'épidémiologie, de la biologie environnementale, de la médecine et de la santé publique pour apprendre comment les solutions technologiques et d'ingénierie aident les scientifiques à comprendre, suivre et modéliser les virus et les épidémies.
Virologie et épidémiologie à l'époque du COVID-19
Instructeur : Rob DeSalle, Ph.D.
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L'auteur du cours, le Dr Rob DeSalle, commence par poser quelques questions fondamentales : Qu'est-ce qu'un virus ? Les virus sont-ils vivants ? Qu'est-ce que la vie ? Bien qu'il n'y ait pas de réponses simples et que beaucoup de choses restent inconnues, les scientifiques ont développé des cadres pour comprendre comment les virus s'intègrent dans la complexité de la vie sur Terre. Dans le premier essai du cours, nous aborderons les bases du virus : la différence entre les virus et les micro-organismes tels que les bactéries, la géométrie virale et la diversité structurelle, ainsi que les cycles de vie et la réplication des virus. Ensuite, le Dr Koenraad Van Doorslaer, virologue, explique comment les virus sont classés et pourquoi cette classification est importante. Lorsque le COVID-19 est devenu une pandémie, la compréhension des liens entre les virus a permis aux scientifiques d'identifier rapidement le CoV-2 du SRAS et ses variantes. La vidéo de cette semaine explore les liens entre les humains, les virus, les autres organismes et les écosystèmes dans lesquels nous vivons tous.
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Pour comprendre ce qu'est un virus, il faut comprendre comment il se réplique dans son hôte. Le Dr DeSalle explique les trois catégories de virus - les virus à ADN, les virus à ARN et les virus à transcription inverse - et leurs cycles de réplication. Bien qu'ils utilisent des stratégies différentes, ils produisent tous de l'ARNm, qui est traduit en protéines dont tous les virus ont besoin pour fonctionner. Michael Tessler explique ensuite comment les scientifiques utilisent la génomique et la bio-informatique pour identifier les virus qui deviennent pathogènes. Enfin, nous examinons de plus près deux maladies virales : Le VIH et le VPH. Dans le premier cas (VIH), les scientifiques travaillent depuis plus de 40 ans à la mise au point d'un vaccin, mais celui-ci reste hors de portée. Dans l'autre cas (le papillomavirus), un vaccin permet de prévenir les cancers depuis plus de dix ans. Dans la première des quatre parties de la série de vidéos sur la fabrication d'un vaccin contre le COVID-19, nous avons préparé le terrain en posant la question suivante : comment se préparer à une pandémie d'un virus qui n'existe pas encore ?
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Comme nous l'avons appris, les virus qui causent les maladies sont des ennemis redoutables, mais notre corps a des moyens de riposte. Nous disposons d'un système immunitaire inné qui s'efforce d'arrêter tous les microbes envahissants et d'un système immunitaire adaptatif qui apprend à combattre certains d'entre eux. Nous vous expliquons certains des mécanismes de ce système très complexe et les médicaments que nous utilisons pour renforcer nos défenses naturelles. Le Dr Tessler présente les différentes méthodes utilisées par les scientifiques pour identifier les virus qui ont franchi nos défenses et nous ont rendus malades. Dans le dernier essai de la semaine, nous rencontrons le Dr Julie Ledgerwood, qui a supervisé les essais cliniques ayant abouti à un vaccin ARNm révolutionnaire contre le COVID-19. Deux vidéos traitent des vaccins : comment ils fonctionnent et comment ils ont été développés et testés.
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Alors que les maladies ont façonné le cours de l'humanité pendant des millénaires, nous assistons à l'émergence de nouveaux agents pathogènes et de pandémies à un rythme sans précédent. COVID-19 est au moins la septième pandémie à toucher l'homme au cours du siècle dernier. Comment cela se fait-il ? Comment les agents pathogènes qui se développent d'abord chez des espèces animales non humaines se propagent-ils à l'homme ? Cette semaine, nous découvrons les docteurs Pallavi Kache et Neil Vora et le domaine de l'écologie des maladies, qui cherche à comprendre les interactions entre les agents pathogènes et leurs hôtes dans le contexte de leur évolution et de leur environnement. Ils expliquent comment les agents pathogènes émergent des hôtes non humains vers les populations humaines et comment nos environnements de plus en plus urbains affectent la propagation des maladies. Ensuite, le Dr Jeffrey Shaman explique comment, une fois qu'un agent pathogène a infecté l'homme, il se propage d'homme à homme, et comment nous mesurons la dynamique de la propagation des maladies. Une série de vidéos explore les pandémies de l'histoire à nos jours, et nous discutons de la manière dont nous savons que les vaccins COVID-19 sont sûrs et efficaces.
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3 vidéos2 lectures1 devoir
La modélisation informatique a été un outil important pendant la pandémie de COVID-19. Le Dr DeSalle explique comment les épidémiologistes utilisent des modèles pour surveiller la propagation de la pandémie, évaluer les efforts déployés pour la contrôler et guider les décideurs politiques dans leurs décisions concernant des mesures telles que la vaccination, la fermeture des écoles et l'allocation des ressources de soins de santé. Dans l'étude de cas du Dr Jude Kong de cette semaine, nous découvrons comment la modélisation a aidé une communauté à prendre des décisions éclairées sur la politique de santé publique pendant la pandémie de COVID-19 et à sauver des vies. Enfin, nous verrons comment les maladies et les pandémies affectent différemment les différentes communautés et comment les experts en santé publique s'efforcent de remédier aux inégalités en matière de santé. Dans la dernière partie de la série vidéo sur la fabrication d'un vaccin contre le COVID-19, nous nous demandons comment nous pouvons utiliser nos nouvelles connaissances sur la technologie de l'ARNm et les inégalités en matière de santé pour garantir de meilleurs résultats à l'avenir.
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Nous commençons cette semaine par un zoom sur la ville de New York, qui a été l'un des épicentres de la pandémie de COVID-19 au début de l'année 2020. Des responsables du département de la santé de la ville de New York décrivent ce qu'a été la gestion de la pandémie sur le terrain et expliquent les leçons qu'ils en ont tirées. Puis nous faisons un zoom arrière pour examiner le passé, le présent et l'avenir des maladies infectieuses émergentes. L'homme vit avec les maladies infectieuses depuis des millénaires, mais pourquoi assiste-t-on à un nombre croissant de débordements, où les virus passent des animaux non humains à l'homme ? Que savons-nous aujourd'hui qui pourrait nous protéger contre de futures épidémies ? Dans le dernier essai du cours, le Dr DeSalle répond à la question suivante : "Comment pouvons-nous nous préparer à de futures pandémies ? Comment pouvons-nous nous préparer à de futures pandémies au niveau local et en tant que communauté mondiale, par le biais de tests, de vaccins, de surveillance et de traitements ?
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