King Abdullah University of Science and Technology
Fundamental Skills in Bioinformatics

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Fundamental Skills in Bioinformatics

Jesper Tegner
Zafer Ali
Vincenzo Lagani

Dozenten: Jesper Tegner

9.150 bereits angemeldet

Bei Coursera Plus enthalten

Verschaffen Sie sich einen Einblick in ein Thema und lernen Sie die Grundlagen.
4.4

(51 Bewertungen)

Stufe Anfänger

Empfohlene Erfahrung

Es dauert 24 Stunden
3 Wochen bei 8 Stunden pro Woche
Flexibler Zeitplan
In Ihrem eigenen Lerntempo lernen
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Stufe Anfänger

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Was Sie lernen werden

  • Basics of R

  • Basics of Python

  • How to analyze bulk RNAseq count data

  • How to analyze single cell RNAseq count data

Kompetenzen, die Sie erwerben

  • Kategorie: Bioinformatics
  • Kategorie: Python Programming
  • Kategorie: R Programming

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13 Aufgaben

Unterrichtet in Englisch

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In diesem Kurs gibt es 4 Module

The first module will explore the basics of programming through R and this will include: working in R and RStudio, understanding data types, loops and ifs. Additionally, the module will provide an introduction to RMarkDown as a tool for sharing code that we will use in the coding lectures.

Das ist alles enthalten

17 Videos2 Lektüren4 Aufgaben

The second module will focus on two aims. Firstly, to master the use of logical values and vectors and its applications in quality control. Secondly, to practice the programming skills while learning how to perform basic statistical analysis. This will include: explorative data analysis, correlation, linear models, T-test, and ANOVA. Finally, we will explore the available resources for R programming.

Das ist alles enthalten

20 Videos1 Lektüre2 Aufgaben6 Programmieraufgaben

The third module will provide the basics of the Python programming language. First, the module will compare Python and R language and learn the programming syntax of Python. Second, the module will work with two key Python modules: pandas and numpy.

Das ist alles enthalten

19 Videos1 Lektüre4 Aufgaben4 Programmieraufgaben1 Unbewertetes Labor

The final module will focus on applying knowledge and understanding of programming in the analysis of real RNA-seq data. R will be used for analysing of bulk RNA-seq and Python for single- cell RNA-seq. The results of both analyses will then be integrated. Finally, the module will provide insights in how to gain deeper knowledge and skills in R.

Das ist alles enthalten

19 Videos2 Lektüren3 Aufgaben4 Programmieraufgaben

Dozenten

Lehrkraftbewertungen
4.8 (15 Bewertungen)
Jesper Tegner
King Abdullah University of Science and Technology
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