Apprenez à utiliser les outils du projet Bioconductor pour effectuer des analyses de données génomiques. Il s'agit du cinquième cours de la spécialisation Big Data génomique de l'Université Johns Hopkins.
Bioconductor pour la science des données génomiques
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Bioconductor pour la science des données génomiques
Ce cours fait partie de Spécialisation Science des données génomiques
Instructeur : Kasper Daniel Hansen, PhD
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3.8
(372 avis)
8 heures pour terminer
3 semaines à 2 heures par semaine
Planning flexible
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Compétences que vous acquerrez
- Catégorie : Bioinformatique
- Catégorie : Bioconductor
- Catégorie : Génomique
- Catégorie : La programmation en R
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Évaluations
4 devoirs
Enseigné en Anglais
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Il y a 4 modules dans ce cours
Le cours portera sur l'installation et l'utilisation du logiciel Bioconductor. Nous discuterons des structures de données communes, y compris les ExpressionSets, SummarizedExperiment et GRanges utilisées dans plusieurs types d'analyses.
Inclus
16 vidéos3 lectures1 devoir
Au cours de cette semaine, nous apprendrons à représenter et à calculer des séquences biologiques, tant au niveau du génome entier qu'au niveau de millions de lectures courtes.
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8 vidéos1 devoir
Cette semaine, nous aborderons les types de données de base, ExpressionSet, biomaRt et R S4.
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Cette semaine, nous aborderons l'obtention de données dans Bioconductor, Rsamtools, oligo, limma et minfi
Inclus
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Instructeur
Évaluations de l’enseignant
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Avis des étudiants
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